WSA w Krakowie w wyroku z 14 marca 2025 r. stanął po stronie spółki, potwierdzając, że na zasadach określonych w art. 18db ust. 4 w zw. z ust. 1 ustawy CIT ma ona prawo pomniejszenia zaliczek PIT specjalistów B+R od miesiąca następującego po miesiącu złożenia zeznania rocznego (bądź korekty zeznania), rozumianego jako miesiąca płatności zaliczki PIT od wynagrodzeń należnych za miesiąc, w którym zostałoby złożone zeznanie lub korekta zeznania.
Sprawa rozpatrywana przez WSA w Krakowie jest następstwem skargi złożonej przez spółkę na interpretację indywidualną wydaną przez dyrektora KIS. Spółka prowadzi działalność związaną z tworzeniem i rozwojem oprogramowań informatycznych, dodatkowo świadczy usługi konsultingowe. Spółka realizuje i będzie realizować w przyszłości działalność B+R, z tytułu której ponosi koszty kwalifikowane. Wskazała, że korzysta i zamierza skorzystać z ulgi B+R za inne lata podatkowe, przy czym kwota kosztów kwalifikowanych do odliczenia w ramach ulgi B+R nie zostanie w całości skonsumowana w danym roku podatkowym ze względu na wysokość osiągniętego dochodu. Taką możliwość spółka przewiduje również w odniesieniu do kolejnych lat podatkowych.
W celu realizacji działalności B+R spółka zatrudnia i będzie zatrudniać w przyszłości specjalistów na podstawie umów o pracę, umów o dzieło oraz umów zlecenia. Będzie obliczała i pobierała zaliczki na podatek dochodowy od osób fizycznych oraz zryczałtowany podatek na zasadach wynikających z przepisów ustawy o PIT.
Spółka zamierza skorzystać z odliczenia, o którym mowa w art. 18db ustawy o CIT, w ramach tzw. ulgi na innowacyjnych pracowników, pomniejszając kwotę podlegających przekazaniu na rachunek urzędu skarbowego zaliczek PIT oraz zryczałtowanego podatku dochodowego, o iloczyn kwoty nieodliczonej i stawki podatku obowiązującej spółkę w danym roku podatkowym.
Uprawnienie do pomniejszenia przysługuje począwszy od miesiąca następującego bezpośrednio po miesiącu, w którym podatnik złożył roczne zeznanie, do końca roku podatkowego, w którym zostało złożone to zeznanie.
Stanowisko dyrektora KIS
Dyrektor KIS w interpretacji indywidualnej stwierdził, że stanowisko spółki jest nieprawidłowe. W uzasadnieniu wskazał, że prawo do pomniejszenia kwoty podlegających przekazaniu na rachunek urzędu skarbowego zaliczek na podatek dochodowy oraz zryczałtowanego podatku dochodowego przysługuje podatnikowi (płatnikowi) począwszy od miesiąca następującego bezpośrednio po miesiącu, w którym został złożony CIT-8. Z ulgi na innowacyjnych pracowników wynika również, że uprawnia ona wyłącznie do zwolnienia podatnika podatku dochodowego od osób prawnych (pełniącego rolę płatnika zaliczek oraz zryczałtowanego podatku) z obowiązku wpłaty pobranych środków z wynagrodzeń pracowników. Tym samym odwołuje się ona do konkretnej zaliczki (pobranej w miesiącu przypadającym bezpośrednio po złożeniu zeznania), ustanawiając wyraźną granicę, które zaliczki mogą podlegać pomniejszeniu, a które nie mogą być pomniejszone w ramach wskazanej ulgi.
Spółka nie zgodziła się ze stanowiskiem organu, który przyjął, że prawo do pomniejszenia kwoty podlegających przekazaniu na rachunek urzędu skarbowego zaliczek na PIT powstaje najwcześniej w drugim miesiącu po złożeniu rocznego zeznania CIT (tj. w odniesieniu do zaliczek PIT pobranych od wynagrodzeń wypłaconych w miesiącu następującym po miesiącu złożenia zeznania CIT). W sytuacji spółki prowadziło to do nieuprawnionej odmowy pomniejszenia przez nią zaliczek PIT od wynagrodzeń specjalistów B+R przekazywanych do urzędu skarbowego od miesiąca następującego po miesiącu złożenia rocznego zeznania CIT.
Prawo do skorzystania z pomniejszenia zaliczek
W sprawie poza sporem pozostało, że spółka ma prawo skorzystać z uprawnienia w zakresie pomniejszenia kwoty podlegających przekazaniu na rachunek urzędu skarbowego zaliczek na podatek dochodowy oraz zryczałtowanego podatku dochodowego o iloczyn kwoty nieodliczonej i stawki podatku obowiązującej podatnika w danym roku podatkowym. Spór dotyczył natomiast określenia, za który miesiąc zaliczki podlegają pomniejszeniu.
W rozumieniu spółki prawo pomniejszenia zaliczek PIT specjalistów B+R występuje od miesiąca następującego po miesiącu złożenia zeznania (bądź korekty zeznania w odniesieniu do roku 2023), rozumianego jako miesiąca płatności zaliczki PIT od wynagrodzeń należnych za miesiąc, w którym zostałoby złożone zeznanie lub korekta zeznania. W tym zakresie sąd przyznał rację spółce.
Od kiedy pomniejszenie
W przypadku spółki wynagrodzenia pracownicze są wypłacane w tym samym miesiącu, za który są należne, a zaliczki PIT z tego tytułu są przekazywane na rachunek właściwego urzędu skarbowego w kolejnym miesiącu, tj. w terminie do 20. dnia miesiąca następującego po miesiącu, w którym pobrano zaliczki (podatek).
Przykład: Wynagrodzenie należne za wykonaną pracę w marcu 2025 r. zostało wypłacane w ostatnim dniu roboczym marca (31 marca 2025 r.), zaś pobrana z tego tytułu zaliczka została przekazana na rachunek urzędu skarbowego w kolejnym miesiącu, w terminie do 21. kwietnia 2025 r. (20 kwietnia 2025 r. przypadał w niedzielę). Zeznanie CIT-8 spółka złożyła w marcu 2025 r. Prawo do pomniejszenia zaliczek PIT będzie jej przysługiwało od kwietnia 2025 r. (tj. od miesiąca następującego bezpośrednio po miesiącu, w którym spółka złożyła CIT-8).
Spółka będzie mogła po raz pierwszy pomniejszyć kwotę podlegających przekazaniu na rachunek urzędu skarbowego zaliczek na podatek PIT specjalistów B+R w odniesieniu do wynagrodzenia należnego i wypłaconego swoim pracownikom w marcu 2025 r., od których zaliczki PIT są transferowane do organu podatkowego w kwietniu 2025 r.
Wyrok Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Krakowie z 14 marca 2025 r., sygn. akt I SA/Kr 70/25
Postawa prawna:
art. 18db ust. 1, ust. 4 ustawy z 15 lutego 1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych (tekst jedn. Dz.U. z 2025 r., poz. 278 ze zm.
